Erst die Gründung des Kantons St. Gallen im Jahre 1803 brachte die Niederlassungsfreiheit, und erst jetzt nahmen einige vereinzelte evangelischgläubige Christen in Wil festen Wohnsitz. Für die kirchlichen Bedürfnisse suchten diese die damals paritätische Kirche in Sirnach auf. In den vierziger Jahren des 19. Jahrhunderts wurden dort jährlich zwei bis drei Kinder aus Wil nach evangelischem Ritus getauft. 1849 wurden die evangelischen Wiler dann auch rechtlich Sirnach zugeteilt. Die katholische Kirchgemeinde Wil gestattete ihnen weiterhin, ihre Toten auf dem Friedhof St. Peter zu beerdigen, eine Konzession, die zehn Jahre später wegen Raummangels allerdings wieder rückgängig gemacht wurde. 1869 legten die Evangelischen südlich von St. Peter einen eigenen Friedhof an; für die Abdankungen stand ihnen wie schon zuvor die katholische Kirche offen.
Die Zahl der Evangelischen verdoppelte sich zwischen 1850 und 1860 auf annähernd zweihundert. Bereits 1863 wählte eine Versammlung eine provisorische Kirchenvorsteherschaft, welche die Kirchgemeindegründung vorbereiten sollte.
Noch im gleichen Monat beschloss eine Versammlung evangelische Männer einstimmig, eine eigene Kirche zu bauen und unter Einbezug von Bronschhofen und Rossrüti eine selbständige Kirchgemeinde zu gründen. Eine Kommission begann sofort mit einer Geldsammlung, an der sich übrigens viele Katholiken grosszügig mitbeteiligten. Bald suchten nun auch die evangelischen Rickenbacher Anschluss an die entstehende Kirchgemeinde. Im Dezember 1888 stimmte ein weitere Versammlung dem Kauf eines Grundstückes an der Toggenburgerstrasse zu, und im Mai 1889 erhielt Architekt Grüebler von Wil den Auftrag für den Kirchenbau.
Am 18. August 1889 um 19 Uhr versammelten sich 62 Stimmberechtigte in der Tonhalle zur Konstituierung der Evangelischen Kirchgemeinde Wil. Diese zählte bei der Gründung 723 Mitglieder (Wil 578, Bronschofen-Rossrüti 88, Rickenbach 57). Eine Woche späte fand "begünstigt vom herrlichsten Wetter und unter Anwesenheit einer zahlreichen Volksmenge von Nah und Fern" ("Wyler Zeitung") die Grundsteinlegung für den Kirchenneubau statt. Und schon ein Jahr später, am 31. August 1890 war Kirchweihe und Installation des ersten evangelischen Pfarrers von Wil. Nochmals die "Wyler Zeitung": "Es war wirklich ein stattlicher Zug, der "durch die untere Bahnhofstrasse nach der Toggenburgerstrasse wallte, wo das schmucke, neue Gotteshaus, an herrlichem Platze stehend, seit einigen Wochen mit seinem schlanken Turm nach oben zeigt und als schönes, wohlgelungenes Werk in allen Teile seinen Meister lobt." Der Neubau war auf 87'800 Franken zustande gekommen; Planung und Bau hatten lediglich 17 Monate beansprucht.
1962 wurde die Alte evangelische Kirche abgebrochen und durch die heutige Kreuzkirche ersetzt. www.ref-wil.ch (Den ausführlichen Artikel von Robert Stadler finden Sie als Textfile)
