Das Stadtmuseum bist 1996 Am 24. Juli 1910 konnte das Ortsmuseum Wil offiziell eröffnet werden. Oeffnungszeiten waren täglich von 10 - 12 Uhr und von 13 - 18 Uhr. Als Eintrittspreise wurden 50 Rappen für Erwachsene, 20 Rappen für Kinder und 30 Rappen pro Person für Gruppen festgesetzt. Kunstmaler Arnold Huber schuf das Museumsplakat, das bis in die 90er-Jahre verwendet wurde.
Der grosse Ausstellungs-Saal war bald zu klein für die vielen Exponate, so dass der neue Besitzer des Hofes, Otto Stiefel, die ehemalige Aebtekapelle restaurieren liess und diese dem Museum zur Verfügung stellte.
Da der Verkehrsverein auf die Dauer das Museum nicht alleine führen konnte, musste eine neue Trägerschaft gefunden werden. Im Uebernahmevertrag vom 5. November 1919 wurde die Ortsbürgergemeinde Wil als neuer und auch heute noch einziger Eigentümer des Ortsmuseums bestimmt.
Bedeutende Zugänge zur Sammlung waren der Rückkauf der romanischen Wiler Mutter -Gottes-Holzstatue für Fr. 200.-- vom Historischen Museum in St. Gallen, und 1926 der "Steckborner-Ofen" von 1748, der mit Hilfe der Gottfried-Keller-Stiftung gekauft werden konnte. Bis heute einer der uptanziehungspunkte ist das 1939 fertiggestellte Stadtmodell im Massstab 1 : 200, das Wil um 1800 zeigt. 1958 erfolgte eine Neumöblierung mit Ausstellungsvitrinen und eine Neubeschriftung. Ueber die Jahre hatte sich ein Besucherschnitt von um die 1500 Personen pro Jahr ergeben, wobei natürlich die vielen Wechselausstellungen und die Wiler Schulklassen wesentlich zu diesem Ergebnis beitrugen.
Seit 1974 heisst das "Ortsmuseum" neu "Stadtmuseum Wil". 1976 gründete der damalige Museumskonservator Rudolf Gruber die Vereinigung "Kunst- und Museumsfreunde Wil und Umgebung". Mit einem Mitgliederbestand von gegen 800 Personen ist dies einer der grössten Vereine in Wil und trägt tatkräftig, sei es durch Käufe von Kulturgütern oder durch Beiträge an Veranstaltungen, zum Fortbestand des Stadtmuseums bei.
Mit der Uebernahme des ganzen Hofgebäudes durch die Stiftung Hof zu Wil, die 1990 errichtet wurde, wurde ein neuer Abschnitt in der Geschichte des Stadtmuseums eingeläutet. Die Renovation des Gebäudes liess auch die Idee einer grundlegenden Neugestaltung des Museums aufkommen. Vorgängig wurde 1992 bis 1994 mit grossem finanziellem Aufwand die umfassende Inventarisation aller Museumsobjekte durch eine externe Firma vorgenommen. Insgesamt 2711 Gegenstände wurden systematisch erfasst und fotografiert. In mehreren Uebungen wurde praktisch der gesamte Museumsbestand durch die Kulturgüterschutzgruppe des Wiler Zivilschutzes in den Kulturgüterschutzraum der Stadt Wil evakuiert.
